Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms