Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdx4Q07424 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms