Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms