Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Thbs3Q05895 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Thbs3Q05895 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Thbs3Q05895 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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