Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms