Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou2f2Q00196 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou2f2Q00196 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms