Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smn1P97801 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smn1P97801 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms