Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hoxd13P70217 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hoxd13P70217 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hoxd13P70217 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hoxd13P70217 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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