Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Acta1P68134 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Acta1P68134 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Acta1P68134 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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