Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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