Protein–RNA interactions for Protein: P61620

Sec61a1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a1P61620 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sec61a1P61620 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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