Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csrnp3P59055 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csrnp3P59055 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms