Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P58686 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms