Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CartptP56388 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms