Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PitpnbP53811 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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