Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtshP49935 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtshP49935 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtshP49935 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtshP49935 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms