Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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