Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VdrP48281 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VdrP48281 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VdrP48281 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VdrP48281 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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