Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms