Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms