Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms