Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms