Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxraP28700 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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