Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc5P27641 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc5P27641 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms