Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrkchP23298 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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