Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim1P20664 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms