Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P20040 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P20040 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P20040 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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