Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms