Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl9P18340 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms