Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Spi1P17433 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Spi1P17433 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms