Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim30aP15533 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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