Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccl20O89093 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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