Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms