Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms