Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole2O54956 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole2O54956 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole2O54956 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms