Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CrxO54751 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CrxO54751 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms