Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clk2O35491 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clk2O35491 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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