Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms