Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ColqO35348 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ColqO35348 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ColqO35348 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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