Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Dgcr6O35347 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dgcr6O35347 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms