Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2O35245 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Pkd2O35245 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2O35245 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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