Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Casq1O09165 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms