Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MttpO08601 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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MttpO08601 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MttpO08601 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms