Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp35M0QWN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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