Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm3542K7N6U2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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