Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Prkar1a-202ENSMUST00000106676 962 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm1821-201ENSMUST00000111388 685 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15577-201ENSMUST00000144350 2293 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm36325-201ENSMUST00000210487 2885 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms