Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms