Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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