Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms