Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms